ريبو سيك للخدمات التقنية

ريبو سيك للخدمات التقنية

مبدأ التقنية

البروتينات هي الجهات الرئيسية المسؤولة عن أنشطة الحياة ، والترجمة التنظيم هو أيضا وسيلة هامة داخل الخلايا التنظيم . الترجمة هي واحدة من الخطوات الرئيسية في التعبير الجيني ، والتي يمكن استخدامها لتوجيه عملية تخليق البروتين من خلال قراءة مرنا ريبوسوم القالب . عملية الترجمة هي التي تسيطر عليها بشكل صارم ، والعديد من الأمراض المرتبطة شذوذ في الترجمة ، مثل الأمراض العصبية ، وفقر الدم ، واضطرابات النمو . على الرغم من أن هيكل ووظيفة الريبوسوم هي دراسة وافية ، آلية تنظيم عملية الترجمة يحتاج إلى مزيد من الدراسة .

ريبوسوم مطبوع تسلسلريبو-سيكيمكن الكشف عن حالة الترجمة في الجسم الحي .ريبو-سيكالتكنولوجيا الأساسية هي تحديد الريبوسوم ملزمة مرنا و حوالي 30 النيوكليوتيدات يجري ترجمتها . تسلسل الحمض النووي الريبي ريبوسوم ملزمة شظايا يمكن أن تسجل بدقة موقع الريبوسوم في الترجمة . مجموعة النسخريبو-سيكمعدل تخليق البروتين يمكن حسابها من خلال الجمع بين تحليل البيانات .

الخصائص التقنية

ريبو-سيكيمكن أن تكشف عن الوقت ، المكان ، والموقع من تخليق البروتين ، البروتين الذي يجري تصنيعه و تنظيم آلية تخليق البروتين .ريبو-سيكوقد تم تطبيقها على نطاق واسع في دراسة الحيوانات والنباتات والكائنات الحية الدقيقة للكشف عن آلية تنظيمية للنمو والتنمية ، morphogenesis ، حدوث المرض والإجهاد استجابة .

تطبيق الاتجاه

ريبو-سيكهذه الطريقة يمكن تطبيقها على دراسة نشاط الترجمة ، وتحديد موقع الترجمة الأولية ، ORF الكلمات و الترجمة الآلية التنظيمية من البروتين .

ريبو-سيكوقد تم تطبيقها على نطاق واسع في دراسة الحيوانات والنباتات والكائنات الحية الدقيقة ، من أجل الكشف عن آلية تنظيمية للنمو والتنمية ، morphogenesis ، حدوث المرض والإجهاد الردود . باختصارريبو-سيكهذه الطريقة يمكن الكشف عن حالة الترجمة من البروتين على مستوى الجينوم ، والحصول على معلومات عن تسلسل مرنا ترجمة وتحليل الترجمة الآلية التنظيمية .

الملك الأزرق ميزة

دورة تجريبية سريعة ، ذات جودة عالية ومستقرة وموثوق بها النتائج .

تجربة غنية من الأنواع .

ريبو سيك للخدمات التقنيةعملية تجريبية

تحليل المحتوى

معيار تحليل الائتمان

تقييم جودة البيانات الخام الترشيح وتسلسل

( 2 ) مقارنة إزالة ريبوسوم الحمض النووي الريبي ، الحمض الريبي النووي النقال ، سيرنا ، الخ .

( 3 ) قراءة طول توزيع الإحصاءات وطول الترشيح

مقارنة إشارة الجينوم

تحليل تسلسل التشبع

توزيع الترددات اللاسلكية في الجينوم

تحليل إيقاع ثلاثي

إحصائيات و تحليل التعبير عن الجينات المترجمة

تحليل علاقة العينة

تحليل الجينات الترجمة التفاضلية بين المجموعات

( 11 ) التحليل الوظيفي على الذهاب و kegg التخصيب

ريبو-سيكجنبا إلى جنب مع تحليل الحمض النووي الريبي seq

( 1 ) حساب كفاءة الترجمة

تحليل العلاقة بين ribo-seq و rna-seq

تحليل العلاقة بين كفاءة الترجمة و مستوى النسخ

تحليل تدفق

حالة تجريبية

طلب عينة

( 1 ) عينات من الخلايا : 5 × 106-1 × 107 العينات الموصى بها .

( 2 ) عينات من الأنسجة الحيوانية : كمية العينة الموصى بها أكثر من 300 ملغ .

( 3 ) عينات من الأنسجة النباتية : كمية العينة الموصى بها أكثر من 500 ملغ .

عينة تجميع

ما لا يقل عن 2 مجموعات من العينات ، بما في ذلك السيطرة على المجموعة ، المجموعة التجريبية ، عدد العينات الموصى بها : 3 ضد 3 .

المراجع

برارGA،وايسمانجي إس. تكشف الملفات الشخصية للريبوزوم عن ماذا ومتى وأين وكيفية توليف البروتين. نات ريف مول سيل بيول. 2015. 16(11):651-664.

تشونغC ، Coukos G ، Bassani-Sternberg M. تحديد مضادات الورم مع immunopeptidomics. نات بيوتكنول. 2022. 40(2):175-188.

فرمينBJ ، Nicolaou C ، Bhatt AS. التنميط المتزامن للريبوزوم لمئات الميكروبات من الميكروبيوم البشري. نات بروتوك. 2021. 16(10):4676-4691.

إنغولياNT ، Brar GA ، Rouskin S ، McGeachy AM ، Weissman JS. استراتيجية تحديد الملفات الشخصية للريبوزوم لمراقبة الترجمة في الحي عن طريق التسلسل العميق لشظايا mRNA المحمية بالريبوزوم. نات بروتوك. 2012. 7(8):1534-1550.

إنغولياNT ، Ghaemmaghami S ، Newman JR ، Weissman JS. تحليل على نطاق الجينوم في الحي للترجمة مع حل النوكليوتيد باستخدام ملف تعريف الريبوسوم. العلوم 2009. 324(5924):218-223.

جونتاونغP ، Girke T ، Bazin J ، Bailey-Serres J. الديناميكيات الترجمة التي كشفت عن طريق التنميط على نطاق الجينوم لبصمات الريبوسوم في Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci U.S.A. 2014. 111(1):E203-212.

سويرEB، Cortes T. تحسين ملف تعريف الريبوسوم فهم ترجمة الميكوباكتيريا. الميكروبيول الأمامي. 2022. 13:976550.

Xiang Y ، Huang W ، Tan L ، Chen T ، He Y ، Irving PS ، Weeks KM ، Zhang QC ، Dong X. دبابيس الشعر الحمض النووي الريبي الواسعة النطاق في المصب تملي اختيار الكودون البدائي بشكل ديناميكي. الطبيعة 2023. 621(7978):423-430.

Xu G, Greene GH, Yoo H, Liu L, Marqués J, Motley J, Dong X. إعادة برمجة الترجمة العالمية هي طبقة أساسية من التنظيم المناعي في النباتات. الطبيعة 2017. 545(7655):487-490.