مفاعل حيويمن خلال التحكم في درجة الحرارة ، ودرجة الحموضة ، تركيز الأوكسجين والمواد الغذائية وغيرها من المعالم الرئيسية ، حافزا بيولوجيا ( مثل الانزيمات والخلايا ) لتوفير بيئة مناسبة . وتشمل مبادئها الأساسية ما يلي :

السيطرة على الظروف البيئية : من خلال تنظيم درجة الحرارة ، ودرجة الحموضة ، تركيز الأوكسجين ، وهلم جرا ، لتلبية احتياجات النمو والتمثيل الغذائي للكائنات الحية .

خلط ونقل الجماعي : استخدام المحرض أو الغاز في النظام ، مثل وسائل الحفاظ على المواد المتفاعلة والكائنات الحية مختلطة بالتساوي ، وتحسين كفاءة النقل الجماعي .

مراقبة الانتاج والمنتجات : من خلال التحكم في عملية رد الفعل من المعلمات ، وتحسين العائد من المنتجات ، والحد من إنتاج المنتجات .

رصد وتعديل : مجهزة نظام الاستشعار ، في الوقت الحقيقي رصد البارامترات الرئيسية في عملية رد الفعل ، وضبط المعلمات السيطرة على أساس التغذية المرتدة إشارة للحفاظ على أفضل رد فعل الشرط .

　　مفاعل حيوييمكن تصنيفها وفقا لمعايير التصنيف المختلفة ، وفيما يلي طرق التصنيف الشائعة :

الهندسة أو الخصائص الهيكلية : غلاية ، أنبوب ، برج ، غشاء ، وهلم جرا .

وفقا لأنواع مختلفة من المواد الحفازة أو زراعة الكائنات الحية الدقيقة : enzymic مفاعل ، خزان التخمير ، الخلية النباتية مفاعل ، مفاعل الخلية الحيوانية ، الخ .

حسب طريقة العرض : الهوائية اللاهوائية مفاعل حيوي مفاعل حيوي .

حسب طريقة خلط مدخلات الطاقة : نوع التحريك ، رفع الهواء نوع خزان التخمير ، جت تعميم نوع خزان التخمير ، الخ .

وفقا لطريقة التشغيل : دفعة مفاعل حيوي ، مفاعل حيوي مستمر وشبه مستمر مفاعل حيوي .

وفقا لتوزيع biocatalysts : الكتلة الحيوية مفاعل ميمبران بيورياكتور . . . . . . .

حسب نظام تدفق المواد المتفاعلة و خلط الدولة : كامل تدفق مختلط مفاعل حيوي ، مكبس تدفق مفاعل حيوي .